Анализ древней ДНК (аДНК) из археологических остатков животных хорошо подходит для многих целей, исследуемых с помощью зооархеологических анализов. Эта статья направлена на представление области палеогеномики, особенно в ее приложении к зооархеологическим вопросам. Хотя статья не претендует на полноту, она сосредоточена на практических вопросах, способствуя продвижению трансдисциплинарного диалога. Авторы дают описания природы аДНК и основных тафономических путей, ведущих к ее дифференциальной сохранности. Затем предлагатся краткий исторический обзор методов аДНК, начиная с первых открытий в 1984–1985 годах до появления секвенирования следующего поколения и подходов высокопроизводительного секвенирования в начале 21 века. Авторами описываются основные проблемы исследований аДНК в последние годы, так как решение этих проблем должно быть адаптировано к новому диапазону методов и должно оказать влияние на изучение остатков животных. Наконец, авторами выделяются основные результаты применения аДНК в будущих направлениях исследований, которые могут быть осуществлены для описания животных и их популяций.