В статье анализируется научная концепция, основанная на понятии иерархических систем. Описаны три вида иерархических систем, которые различаются по уровню сложности организации и по характеру связей и взаимодействия внутрисистемных элементов. Раскрывается понятие сложности организации. На этой теоретической основе показаны различные способы возможного использования естественных и математических наук в исторических и археологических исследованиях.