Современная теория культурного слоя базируется на представлении о неразрывной связи процессов формирования и разрушения слоя культурных остатков. Культурные остатки могли накапливаться как в субаэральных, так и в субаквальных средах. Наибольшим разнообразием отличаются культурные слои в субаэральных отложениях. Не менее важные особенности, показывающие современное состояние культурных слоев, зависели от сценариев разрушения горизонтов культурных остатков. Процессы сингенетической и эпигенетической (постгенетической) деформации протекали по-разному; сингенетическая деструкция в значительной степени была связана с антропогенным воздействием, в отличие от последующих естественных процессов разрушения слоя. Большинство культурных слоев памятников каменного века, расположенных на юге Русской равнины, связано с почвенно-лессовыми отложениями. Стандартная эпигенетическая деформация культурных слоев определялась криогенными и биогенными процессами и приводила к перемещению предметов вверх и вниз из погребенного культурного слоя. Степень такой деформации колеблется от умеренной до весьма значительной. Метод установления связей между деталями кремневых аппликаций позволяет уверенного диагностировать первоначальное стратиграфическое положение культурного слоя, в ряде случаев реконструировать топографию поверхности обитания. Отмечается слабое разрушение участков культурного слоя с плотной (спрессованной) массой культурных остатков.